因厦门市海洋与渔业局行政执法体制改革，2003年8月19日中共厦门市委机构编制委员会批准设立，加挂“中华人民共和国厦门渔港监督局”、“中华人民共和国福建厦门渔业船舶检验局”，正处级全民事业单位，隶属厦门市海洋与渔业局。副处长（法人）郭东宁，副处长辛建军，内设渔港管理科、渔船检验科、渔业无线电管理科、办公室等4个职能科室，下辖派出机构中华人民共和国高崎渔港监督，人员编制30人。单位地址：厦门市思明区大学路154号，邮编：361005，电话：2085981，传真：2089564。

     职能职责
（1）负责渔港及其设施的建设、使用、维护、改造的监督管理工作。
（2）负责渔业船舶的登记管理工作。
（3）负责船舶进出渔港的签证管理及渔港设施的安全监督管理工作，负责渔港水域交通、渔船的安全救助网络的建设。
（4）负责渔业船舶船员、职务船员、报务员的资格考试、发证、审证和换证工作。
（5）负责渔业船舶、船用产品监督检验工作，负责渔业船舶建造图纸的审核工作。
（6）负责对渔船修造厂、渔业船舶设计单位的资格认证工作人员。
（7）负责渔业无线电台（站）的设置与使用、频率管理和渔业无线电设备研制、生产、销售、进口等管理工作，负责渔业安全通讯网的建设。
（8）承担渔业船舶海洋交通战备动员工作。
（9）代征、代缴渔港、渔业无线电、渔业船舶和职务船员的相关费收。

     派出机构
中华人民共和国高崎渔港监督，2006年2月14日中共厦门市委机构编制委员会批准设立，为中华人民共和国厦门渔港监督局的派出机构，相当于正科级。

     历史沿革
1964年6月福建省水产局厦门渔业船舶管理站成立，1984年改称中华人民共和国厦门渔港监督（中华人民共和国船舶检验局渔船分局厦门检验站）并下设东渡、刘五店监督站，1989年8月增设中华人民共和国厦门渔港监督沙坡尾监督站，1993年6月改称中华人民共和国厦门渔港监督局（中华人民共和国福建厦门渔船检验局）并下设沙坡尾渔港监督、东渡渔港监督、刘五店渔港监督。